Googleフォトもかなりの問題児で(^_^;)特にクラウドから削除するとハードディスクからも消されるのは腹立たしいです。なのでパソコンとiPadは一切同期せず、iPadは閲覧とダウンロード専用、パソコンからはフォルダ単位で手動アップロードしてます。
検索機能がとにかく強力なので、Googleフォトで検索かけて見つけた画像のタイムスタンプから、パソコン内の検索かけて元ファイルを見つける、みたいなのが便利です。特にスマホのGPSタグ付き画像も同じ日に混ぜておくと、むちゃくちゃに便利です。
アップデートかかって類似画像や関連画像を優先的に探す機能が強化されてから、狙った型番のカメラ画像をピンポイントで見つけるのが難しくなったのも、腹立たしいです(笑)。回避策も、やっと見つけました。